Суть проблемы:
апстрим, от него бранч с фиксом, в апстрим в это время намерджили всякой фигни, с которой бранч не мерджится. Надо понять, что где поменялось. То есть мне нужно иметь на экране 3 версии - "оригинальная" (от которой бранчевались), "брачевая" (то, что у меня) и "апстрим". И чтобы в каждом из них можно было бы независимо двигать историю, а в идеале ещё и видеть, можно ли мерджить один коммит в другой без конфликтов (ну, или, хотя бы получающийся дифф).
Всё осложняется тем, что это комплект изменений в куче файлов, и сами файлы большого размера.
Я что-то такого не видел. Без картинки мозги совсем пухнут и не могут удержать происходящее.